@TOME V2.2
(Nov 2016)

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Complexes Modeling
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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : ODC_HUMAN: (2015-12-08 )
MSAKPEVSLVREASRQIVAGGSAGLVEICLMHPLDVVKTRFQIQRCATDPNSYKSLVDSFRMIFQMEGLFGFYKGILPPILAETPKRAVKFFTFEQYKKLLGYVSLSPALTFAIAGLGSGLTEAIVVNPFEVVKVGLQANRNTFAEQPSTVGYARQIIKKEGWGLQGLNKGLTATLGRHGVFNMVYFGFYYNVKNMIPVNKDPILEFWRKFGIGLLSGTIASVINIPFDVAKSRIQGPQPVPGEIKYRTCFKTMATVYQEEGILALYKGLLPKIMRLGPGGAVMLLVYEYTYSWLQENW

Atome Classification :

(20 SA) -----------------------------------........-.10....-----.--------...20--.........30----------------......-..40...-------..---.--------.------.---50........60-----......--------.-.70...-----------------.....80......----------------------------..90.---...--------..------..100------...-.------.-...110..--.---..--------------....120.....-----.-.130...-.-...140...---...---..--------------------------150....------...--160..------.......170....-----...180.....-----------------..190......----.200----.-----.-......---.210..-----------......---220....--.-..230........240-.-.-..-...250.......260---....------------.....270----------...---------.....280.......290------.-......-------------------------------------------------------------------------------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) -----------------------------------MSAKPEVS-LVREASR-----Q--------IVAG---GSAGLVEICLM----------------HPLDVV-KTRFQIQ-------RC---A--------T------D---PNSYKSLVDSFR-----MIFQME--------G-LFGFYK-----------------GILPPILAETPKR----------------------------AVKFF---TFE--------QY------KKL-L------GYV-S------L-SPAL--TF--A---IA--------------GLGSGLTEAIVV-----N-PFEVVKV-G-LQANR-NTF---AEQ---PS--------------------------TVGYARQ------IIK--K--EG------WGLQGLNKGLTATL-----GRHGVFNMVYF-----------------GFYYNVKNMIP----VN------K-----D-PILEFW---RKF-GI-----------GLLSGT---IASVINI--P-FDVA-KSRIQGPQPVP-G-E-IK-YRTCFKTMATVYQE-----EGIL------------ALYKGLL-----------PKI---------MRLGPGGAVMLLVYEYTY------S-WLQENW-------------------------------------------------------------------------------------
2 PsiBlast_PDB 78.5726% -42 - C6 -2C3E ADT1_BOVIN A:[9-291] --------------------------------------------------K-----D--------FLAG---GVAAAISKTAV----------------APIERV-KLLLQVQ-------HA---SKQI-----S------A---EKQYKGIIDCVV-----RIPKEQ--------G-FLSFWR-----------------GNLANVIRYFPTQ----------------------------ALNFA---FKD--------KY------KQIFL------GGV-D------R-HKQFWRYF--AGNLAS--------------GGAAGATSLCFV-----Y-PLDFART-R-LAADV-GKG---AAQ---RE--------------------------FTGLGNC------ITK--IF-KS------DGLRGLYQGFNVSV-----QGIIIYRAAYF-----------------GVYDTAKGMLP----DP------K-----NVHIIVSW---M----I-----------AQTVTA---VAGLVSY--P-FDTV-RRRMMMQSGRK-GAD-IM-YTGTVDCWRKIAKD-----EGPK------------AFFKGAW-----------SNV---------LR-GMGGAFVLVLYDEI----------------------------------------------------------------------------------------------------
1 PsiBlast_PDB 78.5426% -42 - C6 -1OKC ADT1_BOVIN A:[9-291] --------------------------------------------------K-----D--------FLAG---GVAAAISKTAV----------------APIERV-KLLLQVQ-------HA---SKQI-----S------A---EKQYKGIIDCVV-----RIPKEQ--------G-FLSFWR-----------------GNLANVIRYFPTQ----------------------------ALNFA---FKD--------KY------KQIFL------GGV-D------R-HKQFWRYF--AGNLAS--------------GGAAGATSLCFV-----Y-PLDFART-R-LAADV-GKG---AAQ---RE--------------------------FTGLGNC------ITK--IF-KS------DGLRGLYQGFNVSV-----QGIIIYRAAYF-----------------GVYDTAKGMLP----DP------K-----NVHIIVSW---M----I-----------AQTVTA---VAGLVSY--P-FDTV-RRRMMMQSGRK-GAD-IM-YTGTVDCWRKIAKD-----EGPK------------AFFKGAW-----------SNV---------LR-GMGGAFVLVLYDEI----------------------------------------------------------------------------------------------------
32 Fugue 77.4623% -45 - C6 -1OKC ADT1_BOVIN A:[2-293] ------------------------------------------D-QALSFLK-----D--------FLAG---GVAAAISKTAV----------------APIERV-KLLLQVQ-------HASKQI--------S------A---EKQYKGIIDCVV-----RIPKEQ--------G-FLSFWR-----------------GNLANVIRYFPTQ----------------------------ALNFA---FKD--------KY------KQI-FLGGVDRHKQ-F------W-RYFA--GN--L---AS--------------GGAAGATSLCFV-----Y-PLDFART-R-LAADV-GKG---AAQ---REFTG-----------------------LGNCITK------IFK--S--DG--------LRGLYQGFNVSV-----QGIIIYRAAYF-----------------GVYDTAKGMLP----DP------K-----N-V--HII---VSW-MI-----------AQTVTA---VAGLVSY--P-FDTV-RRRMMMQSGRK-G-ADIM-YTGTVDCWRKIAKD-----EGPK------------AFFKGAW-----------SNV---------LRGMGGAFVLVLYDEI-----------------------------------------------------------------------------------------------------
23 HHSearch 68.5022% -42 - C6 -1OKC ADT1_BOVIN A:[3-293] --------------------------------------------QALSFLK-----D--------FLAG---GVAAAISKTAV----------------APIERV-KLLLQVQ-------HA---S--------K------QISAEKQYKGIIDCVV-----RIPKEQ--------G-FLSFWR-----------------GNLANVIRYFPTQ----------------------------ALNFA---FKD--------KY------KQI-F------LGG-VDRHKQFW-RYFA--GN--L---AS--------------GGAAGATSLCFV-----Y-PLDFART-R-LAADV-GKGAAQREF---TG--------------------------LGNCITK------IFK--S--DG--------LRGLYQGFNVSV-----QGIIIYRAAYF-----------------GVYDTAKGMLP----DP------K--------NVHII---VSW-MI-----------AQTVTA---VAGLVSY--P-FDTV-RRRMMMQSGRKGA-D-IM-YTGTVDCWRKIAKD-----EGPK------------AFFKGAW-----------SNV---------LRGMG-GAFVLVLYDEI----------------------------------------------------------------------------------------------------
6 PsiBlast_PDB 67.0823% -40 - C6 -4C9Q ADT3_YEAST A:[34-306] --------------------------------------------------------------------G---GVSAAIAKTAA----------------SPIERV-KILIQNQDEMI---KQ---G--------T------L---DKKYSGIVDCFK-----RTAKQE--------G-LISFWR-----------------GNTANVIRYFPTQ----------------------------ALNFA---FKD--------KI------KLM-F------GFK-K------E--GYG--KW--F---AG--------------NLASG-GAAGAL-----S-LLFVYSL-D-FARTR-LAA---DAK---S-------------------------------ARQFNGLTDVYK--KTLKS------DGIAGLYRGFMPSV-----VGIVVYRGLYF-----------------GMFDSLKPL--------------------------FL---ASF-LL-----------GWVVTT---GASTCSY--P-LDTV-RRRMM--MTSG-Q-A-VK-YNGAIDCLKKIVAS-----EGVG------------SLFKGCG-----------ANI---------LRSVAGAGVISMYDQLQM------I-LFGK---------------------------------------------------------------------------------------
4 PsiBlast_PDB 66.3924% -42 - C6 -4C9H ADT2_YEAST A:[30-306] --------------------------------------------------------------------G---GVSAAVAKTAA----------------SPIERV-KLLIQNQDEML---KQ---G--------T------L---DRKYAGILDCFK-----RTATQE--------G-VISFWR-----------------GNTANVIRYFPTQ----------------------------ALNFA---FKD--------KI------KAM-F------GFK-K------E-EGYA--KW--F---AG--------------NLASG-GAAGAL-----S-LLFVYSL-D-YARTR-LAA---DS------------------------------------ARQFNGLIDVYK--KTLKS------DGVAGLYRGFLPSV-----VGIVVYRGLYF-----------------GMYDSLK-----------------------------L---ASF-LL-----------GWVVTT---GASTCSY--P-LDTV-RRRMM--MTSG-Q-A-VK-YDGAFDCLRKIVAA-----EGVG------------SLFKGCG-----------ANI---------LR-GVAGAGVISMYDQLQ------M-ILFGKK-------------------------------------------------------------------------------------
5 PsiBlast_PDB 64.6623% -40 - C6 -4C9J ADT3_YEAST A:[34-306] --------------------------------------------------------------------G---GVSAAIAKTAA----------------SPIERV-KILIQNQDEMI---KQ---G--------T------L---DKKYSGIVDCFK-----RTAKQE--------G-LISFWR-----------------GNTANVIRYFPTQ----------------------------ALNFA---FKD--------KI------KLM-F------GFK-K------E-EGYG--KW--F---AG--------------NLASG-GAAGAL-----S-LLFVYSL-D-FARTR-LAA---DAK---S-------------------------------ARQFNGLTDVYK--KTLKS------DGIAGLYRGFMPSV-----VGIVVYRGLYF-----------------GMFDSLK-----------------------------------F-LL-----------GWVVTT---GASTCSY--P-LDTV-RRRMM--MTSG-Q-A-VK-YNGAIDCLKKIVAS-----EGVG------------SLFKGCG-----------ANI---------LRSVAGAGVISMYDQLQM------I-LFGKKF-------------------------------------------------------------------------------------
36 Fugue 59.6217% -70 - C3 -4NQA NR1H2_HUMAN I:[5-389] -----------------------------KGPAPKMLGHELCR-VCGDKASGFHYNV--------LSCE---GCKGFFRRSVV----------------RG---G-ARRYACRGGG----TC---Q--------M------D---AFMRRKCQQCRL-----RKCKEA--------G-MREQCV-----------------LSEEQIRKKKIRK----------------------------QQQQE---SQS--------QS------QSP-V------GPQ-G------S-SSSA--SG--P---GASPGGSEAGSQGSGEGEGVQLTAAQEL-----M-IQQLVAA-Q-LQCNK-RSF---SDQ---PKVTPWPLGADPQSRDARQQRFAHFTELAIISVQE------IVDFAK--QV------PGFLQLGREDQIAL-----LKASTIEIMLLETARRYNHETECITFLKDFTYSKDDFHR----AG------LQVEFIN-PIFEFS---RAMRRL-----------GLDDAE---YALLIAI--NIFSAD-RPNVQEPGRVE-A-L-QQPYVEALLSYTRIKRP-----QDQL------------RFPRMLM-----------KLV---------SLRTLSSVHSEQVFALRLQDKKLPP-LLSEIWDV-----------------------------------------------------------------------------------
3 PsiBlast_PDB 58.1226% -48 - C6 -2LCK - UCP2_MOUSE A:[16-292] --------------------------------------------------------K--------FLGA---GTAACIADLIT----------------FPLDTA-KVRLQIQGESQGLVRT---A--------A------S---AQ-YRGVLGTIL-----TMVRTE--------G-PRSLYN-----------------GLVAGLQRQMSFA----------------------------SVRIG---LYD--------SV------KQF-Y------TKG-S------E-HAGIG-SR--L---LA--------------GSTTGALAVAVA-----Q-PTDVVKV-R-FQAQA-RAG---GGRRY-QS--------------------------TVEAYKT------IAR--E--EG--------IRGLWKGTSPNV-----ARNAIVNCAEL-----------------VTYDLIKDTLLKANLMT------D-----D-LPCHFT---SAF-GA-----------GFCTTV---IAS------P-VDVV-KTRYM--NSAL-G-Q----YHSAGHCALTMLRK-----EGPR------------AFYKGFM-----------PSF---------LRLGSWNVVMFVTYEQLK------R-ALMAAY-------------------------------------------------------------------------------------
22 HHSearch 55.6124% -46 - C6 -2LCK - UCP2_MOUSE A:[14-301] -------------------------------------------------TV-----K--------FLGA---GTAACIADLIT----------------FPLDTA-KVRLQIQ-------GE---S--------QGLVRTAA---SAQYRGVLGTIL-----TMVRTE--------G-PRSLYN-----------------GLVAGLQRQMSFA----------------------------SVRIG---LYD--------SV------KQF-Y------TKGSE------H-AGIG--SR--L---LA--------------GSTTGALAVAVA-----Q-PTDVVKV-R-FQAQA-RAGGG-RRY---QS--------------------------TVEAYKT------IAR--E--EG--------IRGLWKGTSPNV-----ARNAIVNCAEL-----------------VTYDLIKDTLL----KA------N-----L-MTDDLP---CHF-TS-----------AFGAGF---CTTVIAS--P-VDVV-KTRYMNSALG-------Q-YHSAGHCALTMLRK-----EGPR------------AFYKGFM-----------PSF---------LRLGSWNVVMFVTYEQLK------R-ALMAAY-------------------------------------------------------------------------------------
37 Fugue 53.6413% -94 - C5 -4I6M - ARP9_YEAST B:[3-439] -----------------------------------PFRQDSIL-IIYPRSQ-----T--------TLVQFGLNEETFTVPELE----------------IPTQIY-RTTRQDG-------SY---T--------Y------H---STNKDNKAELIKPIQNGEIIDIS--------A-FTQFLR-----------------LIFVSILSDRANKNQDAFEAELSNIPLLLITHHSWSQSDLEIITQY---VFESLEINNLIQL------PAS-L------AAT-Y------SMISLQ--NC--C---II--------------DVGTHHTDIIPIVDYAQL-DHLVSSI-PMGGQSI-NDS---LKKLLPQW--------------------------DDDQIES------LKK--S--PI------FEVLSKNSDLEFNTFWDEKGNEIKVGKQRFQGCN-------------NLIKNISNRVG----LTLDNIDDI-----N-KAKAVW---ENI-IIVGGTTSISGFKEALLGQ---LLKDHLIIEP-EEEK-SKREEEAKSFV-P-T-IE-YVQCPTVIKLAKYP-----DYFP------------EWKKSGY-----------SEI---------IFLGAQIVSKQIFTHPKD------TFYITREKYNMKGPAALWDVQF-----------------------------------------------------------------------
40 Fugue 51.7513% -70 - C2 -3EDV - SPTB2_HUMAN A:[2-323] ----------------------------SHMRHRLFQLNREVDDLEQWIAE-----R--------EVVA---GSHELGQ--DY----------------EHVTML-QERFREF-------AR---D--------T------G---NIGQERVDTVNH-----LADELINSGHSDAAT-IAEWKD-----------------GLNEAWADLLELI----------------------------DTRTQ---ILA--------AS------YEL-H------KFY-H------D-AKEI--FG--R---IQ--------------DKHKKLPEELGR-----D-QNTVET----LQRMH-TTF---EHD---IQ--------------------------ALGTQVR------QLQ--E--DA------ARLQAAYAG--DKA-----DDIQKRENEVL-----------------EAWKSLLDACE----SR------R-----V-RLVDTG---DKF-RF-----------FSMVRD---LMLWMED--V-IRQI-EAQ-EKPRDVS-S-V-EL-LMNNHQGIKAEIDARNDSFTTCI------------ELGKSLLARKHYASEEIKEKL---------LQLTEKRKEMIDKWEDRW------E-WLRL---------------------------------------------------------------------------------------
41 Fugue 51.4414% -58 - C4 -1Y6I - YC53L_SYNY3 A:[1-233] ------------------------------------MSDNLTE-LSQQLHD-----A--------SEKK---QLTAIAALAEM----------------GEGGQG-ILLDYLA-------KN---V--------P------L---EKPVLAVGNVYQ-----TLRNLE-----------------------------------QETITTQLQRN----------------------------YPTGI---FPL--------QS------AQG-I------DYL-P------L-QEAL--GS--Q---DF--------------ETADEITRDKLC-----E-LA------G-PGASQ-RQW---L------------------------------------YFTE------VEK--F--PA------LDLHTINALWWLHS-----NGN-------F-----------------GFSVQRRLWLA----SG------K-----E--FTKLW---PKI-G--------------------------------WKSG-NVWTRWPKGFT-W-D-LS-AP------------------------------------QGHL-----------PLL---------NQL-RGVRVAESLYRHP-------V-WSQYGW-------------------------------------------------------------------------------------
25 HHSearch 49.5122% -26 - C6 -1OKC ADT1_BOVIN A:[110-293] ----------------------------------------------RYFAG-----N--------LASG---GAAGATSLCFV----------------YPLDFA-RTRLAAD-------VG---K--------GA-----A---QREFTGLGNCIT-----KIFKSD--------G-LRGLYQ-----------------GFNVSVQGIIIYR----------------------------AAYFG---VYD--------TA------KGM-L------PDP-K------N-VHII--VS--W---MI--------------AQTVTAVAGLVS-----Y-PFDTVRR-R-MMMQS-GRKGADIMY---TG--------------------------TVDCWRK------IAK--D--EG--------PKAFFKGAWSNV-----LRGMG-GAFVL-----------------VLYDEI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
35 Fugue 49.0020% -28 - C1 -3UP6 - ? A:[35-358] -----------------------------------TRAQLSID-LVNNVEQ-----QEKINSMRFIVFG---STPGGVRLDVNEHILLSTPETATDIDAQLLEVTSSNDILVV-------VI---A--------N------E---PQSLTSQLDGIA-----NLLTLQ--------EMIYDISSILNSDGQIISATGMPMTGVIRDISIAPDE--------------------------------TK---TVQM-------VI------ERA-V------ARV-D------V-FIEA--IDGGA---VT--------------GYTAGSTSVTLH-----NFSHDSYFVMG-NVGNGTRDN---ADS---SK--------------------------NYGKVKE------DVS--E--SN------L----LTHSWTAAT-----TETWAYS---------------------------SAPGA----EN------R-----K-LLCSFYTAERLF-K-----------------------SDYSD--R-LSISMANVLKGPSDVT-G-I-TG------KVIESVTKV-----DGTG------------SPTAQPF-----------TEIRRNNVYQVTARVGKIGIQILTISV--------------EDW-------------------------------------------------------------------------------------
34 Fugue 42.7914% -53 - C6 -4L6Y - PRC1_HUMAN A:[6-454] RRSEVLAEESIVCLQKALNHLREIWELIGIPEDQRLQRTEVVK-KHIKELL-----D--------MMIA---EEESLKER-LI----------------KSISVC-QKELNTL-------CS---ELHVEPFQEE------G---ETTILQLEKDLR-----TQVELM--------R-KQKKER-----------------KQELKLLQEQDQE----------------------------LCEIL---CMP--------HY------DID-S------ASVPS------L-EELN--QF--R---QH--------------VTTLRETKASRR-----E-EFVSIKR-Q-IILCM-EEL---DHT---PD--------------------------TSFERDV------VCE--D--EDAFCLSLENIATLQKLLRQLE-----MQKSQNEAVCE-----------------GLRTQIRELWD----RL------Q-----I-P--EEE---REA-VA-----------TIMSGSKAKVRKALQL--E-VDRL-EELKMQNMKKV-I-E-AI-RVELVQYWDQCFYS-----QEQRQAFAPFCAEYTESLLQLHD-----------AEI---------VRLKNYYEVHKELFEGVQ------K-W-EETWRLFLEFERKASDPNRRGGNLLKEEKQRAKLQKMLPKLEEELKARIELWEQEHSKAFMVNGQKFMEYVAEQWEMHRLEKERAKQER
24 HHSearch 42.7525% -29 - C6 -2LCK - UCP2_MOUSE A:[114-302] ----------------------------------------------AGIGS-----R--------LLAG---STTGALAVAVA----------------QPTDVV-KVRFQAQ-------AR---A--------G------G---GRRYQSTVEAYK-----TIAREE--------G-IRGLWK-----------------GTSPNVARNAIVN----------------------------CAELV---TYD--------LI------KDT-L------LKA-NLM----T-DDLP--CH--F---TS--------------AFGAGFCTTVIA-----S-PVDVVKT-R-YMNSA-LG-----QY---HS--------------------------AGHCALT------MLR--K--EG--------PRAFYKGFMPSF-----LRLGSWNVVMF-----------------VTYEQLKRALM----AA------Y-----Q-SREAPF------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
17 PsiBlast_PDB 41.8330%-143 - C6 -3IJL AEEP_BACTN A:[33-104] --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IEYE--------G-VTGYGE-----------------ASMPPYLGETVES----------------------------VMNFLKKVNLE--------QFSDPFQLEDI-L------SYVDS------L-SPKD--TA--A---KA--------------AVDIALHDLVGK-----L-LGAPWYK-I-WGLNK-EKT---PST---TF--------------------------TIGIDTP------DVV--R--AK------TKECAGLFNILKVK-----LGRDNDKEMIE-----------------TIRSVTDLPIA----VD------A-----N-QGWKDR---QYA-LD-----------MIHWLK---EKGIVMI--E-QPMP-KEQLDDIAWVT-Q-Q-SP-LPVFADESLQRLGD-----VAAL------------KGAFTGI-----------NIK---------LMKCTGMREAWKMVTLAH------A-LGMRVM-------------------------------------------------------------------------------------
16 PsiBlast_PDB 41.4730%-135 - C6 -3IJI AEEP_BACTN A:[33-104] --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IEYE--------G-VTGYGE-----------------ASMPPYLGETVES----------------------------VMNFLKKVNLE--------QFSDPFQLEDI-L------SYVDS------L-SPKD--TA--A---KA--------------AVDIALHDLVGK-----L-LGAPWYK-I-WGLNK-EKT---PST---TF--------------------------TIGIDTP------DVV--R--AK------TKECAGLFNILKVK-----LGRDNDKEMIE-----------------TIRSVTDLPIA----VD------A-----N-QGWKDR---QYA-LD-----------MIHWLK---EKGIVMI--E-QPMP-KEQLDDIAWVT-Q-Q-SP-LPVFADESLQRLGD-----VAAL------------KGAFTGI-----------NIK---------LMKCTGMREAWKMVTLAH------A-LGMRVM-------------------------------------------------------------------------------------
18 PsiBlast_PDB 41.1030%-142 - C6 -3IJQ AEEP_BACTN A:[33-104] --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IEYE--------G-VTGYGE-----------------ASMPPYLGETVES----------------------------VMNFLKKVNLE--------QFSDPFQLEDI-L------SYVDS------L-SPKD--TA--A---KA--------------AVDIALHDLVGK-----L-LGAPWYK-I-WGLNK-EKT---PST---TF--------------------------TIGIDTP------DVV--R--AK------TKECAGLFNILKVK-----LGRDNDKEMIE-----------------TIRSVTDLPIA----VD------A-----N-QGWKDR---QYA-LD-----------MIHWLK---EKGIVMI--E-QPMP-KEQLDDIAWVT-Q-Q-SP-LPVFADESLQRLGD-----VAAL------------KGAFTGI-----------NIK---------LMKCTGMREAWKMVTLAH------A-LGMRVM-------------------------------------------------------------------------------------