@TOME V2.2
(Nov 2016)

Ref. - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : KMCP1_HUMAN: (2015-12-08 )
MSALNWKPFVYGGLASITAECGTFPIDLTKTRLQIQGQTNDAKFKEIRYRGMLHALVRIGREEGLKALYSGIAPAMLRQASYGTIKIGTYQSLKRLFIERPEDETLPINVICGILSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQSNTIQGGMIGNFMNIYQQEGTRGLWKGVSLTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLILSGLMGDTVYTHFLSSFTCGLAGALASNPVDVVRTRMMNQRVLRDGRCSGYTGTLDCLLQTWKNEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNIIFFVTYEQLKKLDL

Atome Classification :

(20 SA) -------------------------------------------------------......--------------...10........20..----------------..---------.-----------------.---.-------.30.......----.40--.------.--....---..50----------------------..-------......-60.----..-----------------------------------.....70......--..80......-----..90......---.-----.---100-----.---....-----..110-----------.---..-----------------....120...-....130..-------.....140-----...--------.----.....---150..------.----....160---.....-----------------------..-----------170--....----..----..180...-----------...-----.190---...---...----.-----..200.....--.----.210.....--------..220.......230.......240..-----------.....-250.------......260---.......------270..----...-------------------..280.......290---------------------------------------------------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) -------------------------------------------------------MSALNW--------------KPFVYGGLASITAECGT----------------FP---------I-----------------D---L-------TKTRLQIQGQ----TND--A------K--FKEI---RYRG----------------------ML-------HALVRI-GRE----EG-----------------------------------LKALYSGIAPAML--RQASYGTIKI-----GTYQSLKRLF---I-----E---RPE-----D---ETLP-----INVIC-----------G---IL-----------------SGVISSTIAN-PTDVLKIRM-------QAQSNT-------IQG--------G----MIGNF---MNIYQ------Q----EGTRGLW---KGVSL-----------------------TA-----------QR---AAIV----VG----VELPVYDI-----------TKK-----HL-----ILS---GLM----G-----DTVYTHFLSS--F----TCGLAGALA--------SNPVDVVRTRMMNQRVLRDGRCSGYTG-----------TLDCL-LQTW------KNEGFFALY---KGFWPNW------LRLGP----WNI-------------------IFFVTYEQLKKLDL----------------------------------------------------------
30 Fugue 81.1627% -48 - C5 -1OKC ADT1_BOVIN A:[2-293] ------------------------------------------------------DQALSFL--------------KDFLAGGVAAAISKTAV----------------AP---------I-----------------E---R-------VKLLLQVQHA----SKQ--I------S---AEK---QYKG----------------------II-------DCVVRI-PKE----QG-----------------------------------FLSFWRGNLANVI--RYFPTQALNF-----AFKDKYKQIF---LGGVDRH---KQF-----W---RYFA-----GNLAS-----------G---GA-----------------AGATSLCFVY-PLDFARTRL-------AADVGK-------GAAQREFT---G----LGNCI---TKIFK------S----DGLRGLY---QGFNV-----------------------SV-----------QG---IIIY----RA----AYFGVYDT-----------AKG-----ML-----PDP---K------N-----VHIIVSWMIA--Q----TVTAVAGLV--------SYPFDTVRRRMMMQ-SGRKGADIMYTG-----------TVDCW-RKIA------KDEGPKAFF---KGAWSNV------LRGMG-----GA-------------------FVLVLYDEI---------------------------------------------------------------
1 PsiBlast_PDB 75.0638% -58 - C5 -2LCK - UCP2_MOUSE A:[17-296] -----------------------------------------------------------------------------FLGAGTAACIADLIT----------------FP---------L-----------------D---T-------AKVRLQIQGE----SQGLVR------T--AASA---QYRG----------------------VL-------GTILTM-VRT----EG-----------------------------------PRSLYNGLVAGLQ--RQMSFASVRI-----GLYDSVKQFY---T-----K---GSE-----H---AGIG-----SRLLA-----------G---ST-----------------TGALAVAVAQ-PTDVVKVRF-------QAQARA-------GGGRRYQ----S----TVEAY---KTIAR------E----EGIRGLW---KGTSP-----------------------NV-----------AR---NAIV----NC----AELVTYDL-----------IKD-----TL-----LKA---NLM----T-----DDLPCHFTSA--F----GAGFCTTVI--------ASPVDVVKTRYMNSAL------GQYHS-----------AGHCA-LTML------RKEGPRAFY---KGFMPSF------LRLGS----WNV-------------------VMFVTYEQLKRALM----------------------------------------------------------
21 HHSearch 74.2627% -44 - C5 -1OKC ADT1_BOVIN A:[6-293] ----------------------------------------------------------SFL--------------KDFLAGGVAAAISKTAV----------------AP---------I-----------------E---R-------VKLLLQVQHA----SKQ--I------S---AEK---QYKG----------------------II-------DCVVRI-PKE----QG-----------------------------------FLSFWRGNLANVI--RYFPTQALNF-----AFKDKYKQIF---L-----G---GVDRHKQFW---RYFA-----GNLAS-----------G---GA-----------------AGATSLCFVY-PLDFARTRL-------AADVGKGAAQR--EFT--------G----LGNCI---TKIFK------S----DGLRGLY---QGFNV-----------------------SV-----------QG---IIIY----RA----AYFGVYDT-----------AKG-----ML-----PDP---K------N-----VHIIVSWMIA--Q----TVTAVAGLV--------SYPFDTVRRRMMMQSGRK-GADIMYTG-----------TVDCW-RKIA------KDEGPKAFF---KGAWSNV------LRGMG-----GA-------------------FVLVLYDEI---------------------------------------------------------------
3 PsiBlast_PDB 73.7327% -43 - C5 -2C3E ADT1_BOVIN A:[9-293] ---------------------------------------------------------------------------KDFLAGGVAAAISKTAV----------------AP---------I-----------------E---R-------VKLLLQVQHA----SKQ--I------S---AEK---QYKG----------------------II-------DCVVRI-PKE----QG-----------------------------------FLSFWRGNLANVI--RYFPTQALNF-----AFKDKYKQIFLGGV-----D---RHK-----QFW-RYFA-----GNLAS-----------G---GA-----------------AGATSLCFVY-PLDFARTRL-------AADVGK-------GAAQREFT---G----LGNCI---TKIFK------S----DGLRGLY---QGFNV-----------------------SV-----------QG---IIIY----RA----AYFGVYDT-----------AK-------------------GML----P-----DPKNVHIIVS--WMIAQTVTAVAGLV--------SYPFDTVRRRMMMQSG-RKGADIMYTG-----------TVDCW-RKIA------KDEGPKAFF---KGAWSNV------LR-GM----GGA-------------------FVLVLYDEI---------------------------------------------------------------
2 PsiBlast_PDB 72.2627% -43 - C5 -1OKC ADT1_BOVIN A:[9-293] ---------------------------------------------------------------------------KDFLAGGVAAAISKTAV----------------AP---------I-----------------E---R-------VKLLLQVQHA----SKQ--I------S---AEK---QYKG----------------------II-------DCVVRI-PKE----QG-----------------------------------FLSFWRGNLANVI--RYFPTQALNF-----AFKDKYKQIFLGGV-----D---RHK-----QFW-RYFA-----GNLAS-----------G---GA-----------------AGATSLCFVY-PLDFARTRL-------AADVGK-------GAAQREFT---G----LGNCI---TKIFK------S----DGLRGLY---QGFNV-----------------------SV-----------QG---IIIY----RA----AYFGVYDT-----------AK-------------------GML----P-----DPKNVHIIVS--WMIAQTVTAVAGLV--------SYPFDTVRRRMMMQSG-RKGADIMYTG-----------TVDCW-RKIA------KDEGPKAFF---KGAWSNV------LR-GM----GGA-------------------FVLVLYDEI---------------------------------------------------------------
20 HHSearch 72.0839% -54 - C5 -2LCK - UCP2_MOUSE A:[14-298] ------------------------------------------------------------T--------------VKFLGAGTAACIADLIT----------------FP---------L-----------------D---T-------AKVRLQIQGE----SQG--L------VRTAASA---QYRG----------------------VL-------GTILTM-VRT----EG-----------------------------------PRSLYNGLVAGLQ--RQMSFASVRI-----GLYDSVKQFY---T-----K---GSE-----H---AGIG-----SRLLA-----------G---ST-----------------TGALAVAVAQ-PTDVVKVRF-------QAQARAGGGR---RYQ--------S----TVEAY---KTIAR------E----EGIRGLW---KGTSP-----------------------NV-----------AR---NAIV----NC----AELVTYDL-----------IKD-----TL-----LKA---NLM----T-----DDLPCHFTSA--F----GAGFCTTVI--------ASPVDVVKTRYMNSALG------QYHS-----------AGHCA-LTML------RKEGPRAFY---KGFMPSF------LRLGS----WNV-------------------VMFVTYEQLKRALM----------------------------------------------------------
6 PsiBlast_PDB 71.6524% -45 - C5 -4C9H ADT2_YEAST A:[27-309] -----------------------------------------------------------------------------FLMGGVSAAVAKTAA----------------SP---------I-----------------E---R-------VKLLIQNQDE----MLK--Q------G--TLDR---KYAG----------------------IL-------DCFKRT-ATQ----EG-----------------------------------VISFWRGNTANVI--RYFPTQALNF-----AFKDKIKAMF---G-----F---KKE-----EGYAKWFA-----GNLAS-----------G---GA-----------------AGALSLLFVY-SLDYARTRL-------AADS--------------------------ARQFNGLIDVYK------KTLKSDGVAGLY---RGFLP-----------------------SV-----------VG---IVVY----RG----LYFGMYD------------SLK----------------------------------LASFLLG--W----VVTTGASTC--------SYPLDTVRRRMM----MTSGQAVKYDG-----------AFDCL-RKIV------AAEGVGSLF---KGCGANI------LR-GV----AGA-------------------GVISMYDQLQMILF----------------------------------------------------------
32 Fugue 70.1716% -73 - C4 -4QLA HYEP_BOMMO A:[19-442] -------------------------------------------------------LDLEEWWGPPELKQKQDTSIKPFEITFSETMVKELKERIKKRRPFAPPLEGVGFK---------Y-----------------G---F-------NSKQLDSWLK----YWA--E------E--YPFA---ERQK----------------------FLNQYP---HFKTNI--------QG-----------------------------------LNIHFMRITPKVP--KGVEIVPLLLLHGWPGSVREFYEAI---P-----HLTAVSK-----D---RNFA-----LEIIAPSLPGYGFSDAA---VR-----------------PGLAAAEVAV-IFKNLMARL-------GYKQYY-------VQG--------GDWGALIGSA---MATFF------P----KEIIGFH---SNMAL-----------------------TL-----------SP---AATF----LE----FVGALFPSLIVEPE-----LAN-----RLYPLSEKYS---TLL----E-----ELGYMHIQAT--K----PDTVGIGLT--------DSPAGLLAYILEKFSTWTNPDLRSKEDGGLSYRWTKDQLIDNL-MLYW------STKSIVTSM---RLYAESFSSRHFDLKLDE----IQVQVPTWVLQAKHELAYQPPCILKMKYPKLVNASVIEDGGHFLAFELPEIFAKDVLKAIGEFRKLKN--------------------------
4 PsiBlast_PDB 68.5723% -37 - C5 -4C9J ADT3_YEAST A:[31-298] -----------------------------------------------------------------------------FLMGGVSAAIAKTAA----------------SP---------I-----------------E---R-------VKILIQNQDE----MIK--Q------G--TLDK---KYSG----------------------IV-------DCFKRT-AKQ----EG-----------------------------------LISFWRGNTANVI--RYFPTQALNF-----AFKDKIKLMF---G-----F---KKE-----EGYGKWFA-----GNLAS-----------G---GA-----------------AGALSLLFVY-SLDFARTRL-------AADAKS------------------------ARQFNGLTDVYK------KTLKSDGIAGLY---RGFMP-----------------------SV-----------VG---IVVY----RG----LYFGMFD------------SLK-------------------------------------FLLG--W----VVTTGASTC--------SYPLDTVRRRMM----MTSGQAVKYNG-----------AIDCL-KKIV------ASEGVGSLF---KGCGANI------LRSVA----GAG-------------------VISMYDQLQMILFG----------------------------------------------------------
5 PsiBlast_PDB 66.1123% -38 - C5 -4C9Q ADT3_YEAST A:[31-298] -----------------------------------------------------------------------------FLMGGVSAAIAKTAA----------------SP---------I-----------------E---R-------VKILIQNQDE----MIK--Q------G--TLDK---KYSG----------------------IV-------DCFKRT-AKQ----EG-----------------------------------LISFWRGNTANVI--RYFPTQALNF-----AFKDKIKLMF---G-----F---KKE------GYGKWFA-----GNLAS-----------G---GA-----------------AGALSLLFVY-SLDFARTRL-------AADAKS------------------------ARQFNGLTDVYK------KTLKSDGIAGLY---RGFMP-----------------------SV-----------VG---IVVY----RG----LYFGMFD------------SLK-----PL--------------------------FLASFLLG--W----VVTTGASTC--------SYPLDTVRRRMM----MTSGQAVKYNG-----------AIDCL-KKIV------ASEGVGSLF---KGCGANI------LRSVA----GAG-------------------VISMYDQLQMILFG----------------------------------------------------------
34 Fugue 64.1718% -73 - C2 -4J1Q A:[20-445] HMERLMLEPVWEKQNEELSYTEHIIVLFETERSVTDSIASHMKDARVITLNEAVGHIAERY--------------QCYMQNIFELLQSKVRK----------------LSAGRIIIQAIV-----------------P---L-------EKEKQLFAGV----SGL--F------K--TAEI---EFSK----------------------LT-------AQVIEI-EKP----EE-----------------------------------MIDLHLKLKDDSR--RPFDK-QIRY-----EAGYRFVKGW---R-----E---MVD-----T---LHMPWRDEGVYLIT-----------GGAGSL-----------------GLLFAKEIAN-RTGRSTIVLTGRSVLSEDKENE-------LEA--------L----RSIGA---EVVYREADVSDQ----HAVRHLL---EEIKERYGTLNGIIHGAGSSKDRFIIHKTN-----------EE---FQEVLQPKVS----GLLHVDEC-----------SKDFPLDFFI-----FFSSVSGCL----GNAGQADYAAANSFMD--A----FAEYRRSLA--------ASKKRFGSTISFNWPLWEEGGMQVGAE-----------DEKRM-LKTTGMVPMPTDSGLKAFY---QGIVSD-----------------KP-------------------QVFVMEGQLQKMKQKLL-------------------------------------------------------
31 Fugue 63.3119% -58 - C4 -3ACP - RPN14_YEAST A:[1-417] ---------------------------------------------------MTKTITVAHI--------------QYDFKAVLEENDENDDE----------------FY---------I-----------------N---VDKNLNEIKEHKIVVLGN----SRG--VDAGKGNT--FEKVGSHLYKA----------------------RLDGHDFLFNTIIRD-GSK----ML-----------------------------------KRADYTAVDTAKLQMRRFILGTTE------GDIKVLDSNF---N-----L---QRE-----I---DQAH-----VSEIT-----------K---LKFFPSG------------EALISSSQDM-QLKIWSVKD-------GSNPRT-------LIGHRATVTDIA----IIDRG---RNVLS------ASL--DGTIRLWECGTGTTI-----------------------HTFNRKENPHDGVNS---IALF----VG----TDRQLHEISTSKKNNLEFGTYG-----KY-----VIA---GHV----S-----GVITVHNVFSKEQ----TIQLPSKFT--------CS-CNSLTVDGNNANYIYAGYENGMLA-----------QWD-L-RSPE------CPVGEFLIN---EGTPINN------VYFAA----GAL-------------------FVSSGFDTSIKLDIISDPESERPAIEFETPTFLVSNDDEVSQFCYVSDDESNGEVLEVGKNNFCALYNLSNP
39 Fugue 62.1817% -54 - C1 -4QFR AAKG1_RAT C:[28-322] ------------------------------------YTTFMKSHRCYDLIPTSSKLVVFDT--------------SLQVKKAFFALVTNGVR----------------AA---------P-----------------L---W-------DSKKQSFVGM----LTI--T------D--FINI---LHRY----------------------YK-------SALVQI-YEL----EE-----------------------------------HK--IETWREVYL--QDSFKPLVCI-----SPNASLFDAV---S-----S---LIR-----N---KIHR-----LPVI------------D---PE-----------------SGN-TLYILT-HKRILKF-L-------KLFITS-------LEE--------L----QIGTY---ANIAM------V----RTTTPVY---VALGI-----------------------FV-----------QHRVSALPV----VD----EKGRVVDI-----------YSK-----FD-----VIN---LAA----E-----KT--------------------------------YNNLDVSVTKALQHRVLKCYLHETLEA-----------IINRL-VEAE------VHRLVVVDE---HD---------------------VV-------------------KGIVSLSDILQALV----------------------------------------------------------
22 HHSearch 53.3219% -50 * C5 *1OKC ADT1_BOVIN A:[6-201] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SFL-----KDFLA-----------G---GV-----------------AAAISKTAVA-PIERVKLLL-------QVQHASKQISAEKQYK--------G----IIDCV---VRIPK------E----QGFLSFW---RGNLA-----------------------NV-----------IR---YFPT----QA----LNFAFKDK-----------YKQ-----IF-----LGG---VDRHKQFW-----RYFAGNLASG--G----AAGATSLCF--------VYPLDFARTRLAADVGKG-AAQREFTG-----------LGNCI-TKIF------KSDGLRGLY---QGFNVSV------QGIII----YRA-------------------AYFGVYDTAKGMLP----------------------------------------------------------
37 Fugue 51.3812% -29 - C3 -3IYM - ? A:[39-434] -------------------------------------------------------ASASKA--------------AAFAQGGSSDPVPMPGK----------------YP---------VVFSTGAGEPTRDQEFALP---V-------HKAFPLFGSVSDKYRRN--P------R--YAEF---RAHSEFTDGVFGTHLAVSSLLRLAQQLV-------HAHVNM-GLP----LGDFAPLASSDVRIPSALASVVNQFGEFSSPSIGTRFLLRDFEHAVSRVV--FLADQLWTNG-----NSHHIFARSW---L-----P---MSN-----N---DGNF-----KTIVA-----------S---RLLEFISAGDLSILPTVLEDAVLSGEVPE-AWEQVKDLL-------GDAPGV-------GQV--------D----RRDRF---DFLFK------S----YADVGQF---TTAFT-----------------------TQ-----------AA---SDVL----TE----LGLPWNSP-----------SAG-----HL-----NWQ----YS----T-----KQRFTFLADT--W----AKLSAAYSQFFELSSGLATRQSATGSHAQMVDLTSVEGVTVLKA-----------ALALS-APEF------SLAACFPPS---CIFVGGL------TRRVV----VTT-------------------SLSVSQRATEFCQMDWR-------------------------------------------------------
35 Fugue 51.3614% -51 * C4 *3GN6 ? A:[22-321] ------------------------------------------------------------F--------------NPWTDAALDTIVNQALT----------------LY---------A-----------------EMRVV-------PAHHDAFLAA----IDT--V------S--AKLR---VLPG----------------------FL-------SLALKQMSGDSTMVKN-----------------------------------YPETYKGV----L--ATAYLDGVAA-----GTQPYFYNLF---V-----R---FAD-----G---RAAR-----AAGFE-----------A---LF-----------------ETHIHPLLHAMADGP---EL-------LAYRAV-------LQS--------V----VAGDR---HAIYRG-----A----EEIRSFL---RRPVE-----------------------LP-----------ER---ETVT----VENHVMVPEDKHAA-----------WEP-----QV-----AIL---LQV----A-----QDTFEPQDEP--S----GVGLPGARD--------NRYYR----KALSTEILRNAHADG--G-----------LRAYIMHGVW------ESVWDHENSHLDPRFLAAA------GPVGAAAVVGPV-------------------EPFYLTRRLVVAD-----------------------------------------------------------
23 HHSearch 47.2724% -26 - C5 -2LCK - UCP2_MOUSE A:[115-301] ----------------------------------------------------------GIG--------------SRLLAGSTTGALAVAVA----------------QP---------T-----------------D---V-------VKVRFQAQAR----AGG--------------GR---RYQS----------------------TV-------EAYKTI-ARE----EG-----------------------------------IRGLWKGTSPNVA--RNAIVNCAEL-----VTYDLIKDTL---L-----K---ANLM----T---DDLP-----CHFTS-----------A---FG-----------------AGFCTTVIAS-PVDVVKTRY-------MNSALG-------QYH--------S----AGHCA---LTMLR------K----EGPRAFY---KGFMP-----------------------SF-----------LR---LGSW----NV----VMFVTYEQ-----------LKR-----AL-----MAA---YQS----R-----EAPF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
8 PsiBlast_PDB 43.5846% -64 - C5 -2YHM - NCAP_HRSVA A:[54-83] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TED--A------N--HKFT---GLIG----------------------ML-------YAMSRL-GRE----DT-----------------------------------IKILRDAGYHVKA--NGVDVTTHRQ-----DINGKEMKFE---V-----L---TLA-----S---LTTE-----IQINI-----------E---IE-----------------SRKSYKKMLK-EMGEVAPEY-------RHDSPD-------CGM--------I----ILCIA---ALVIT------K----LAAGDRS---GLTAV-----------------------IR-----------RA---NNVL----KN----EMKRYKGL-----------LPK-----DI-----ANS---FYE----V-----FEKHPHFIDV--F----VHFGIAQSS--------TRGGSRVEGIFAGLFMNAYGAGQVMLR-----------WGVLA-KSVK------NIMLGHASV---QAEMEQV------VEVYE----YAQ-------------------KLGGEAGFYHILNN----------------------------------------------------------
9 PsiBlast_PDB 42.8646% -64 - C5 -2WJ8 - NCAP_HRSVA A:[54-83] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TED--A------N--HKFT---GLIG----------------------ML-------YAMSRL-GRE----DT-----------------------------------IKILRDAGYHVKA--NGVDVTTHRQ-----DINGKEMKFE---V-----L---TLA-----S---LTTE-----IQINI-----------E---IE-----------------SRKSYKKMLK-EMGEVAPEY-------RHDSPD-------CGM--------I----ILCIA---ALVIT------K----LAAGDRS---GLTAV-----------------------IR-----------RA---NNVL----KN----EMKRYKGL-----------LPK-----DI-----ANS---FYE----V-----FEKHPHFIDV--F----VHFGIAQSS--------TRGGSRVEGIFAGLFMNAYGAGQVMLR-----------WGVLA-KSVK------NIMLGHASV---QAEMEQV------VEVYE----YAQ-------------------KLGGEAGFYHILNN----------------------------------------------------------
18 PsiBlast_PDB 42.5646% -42 - C5 -4UCD - ? A:[27-56] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TED--A------N--HKFT---GLIG----------------------ML-------YAMSRL-GRE----DT-----------------------------------IKILRDAGYHVKA--NGVDVTTHRQ-----DINGKEMKFE---V-----L---TLA-----S---LTTE-----IQINI-----------E---IE-----------------SRKSYKKMLK-EMGEVAPEY-------RHDSPD-------CGM--------I----ILCIA---ALVIT------K----LAAGRSG---LTAVI-----------------------RR-----------AN---NVLK----NE----MKRYKGLL-----------PKD-----IA-----NSF---YEV----F-----EKHPHFIDVF--V----HFGIAQSST--------GGSRVEGIFAGLFMNAYGL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------